Ha pasado un año tras los dramáticos sucesos de Tales of Xillia en los que ambos mundos, Rieze Maxia y Elympios, se unieron tras la eliminación de la barrera que los separaba. Elympios es una nación moderna con un alto nivel de progreso tecnológico logrado mediante el uso de spyrix, mientras que Rieze Maxia es una tierra que antaño vivió aislada y que se basa en las artes espirituales y la naturaleza. Aunque ambos mundos trabajan por la paz común, aún se producen numerosos choques por las diferencias culturales. Pasará algún tiempo hasta que se logre la paz real. Jude, Milla y los personajes de Rieze Maxia del primer Tales of Xillia luchan por vivir su vida y lograr la paz en este nuevo mundo unido.
Tales of Xillia 2 gira en torno a Ludger Kresnik, un joven y hábil chef que vive en la ciudad de Trigleph, en Elympios, con su hermano Julius y su gato Rollo. Se esfuerza mucho por seguir los pasos de su hermano y trabajar como agente en la prestigiosa corporación Spirius, una gran compañía que desarrolla tecnología para cualquier campo imaginable. Un día, por casualidad, conoce a Elle Marta, una chica que viaja sola con la idea de reunirse con su padre en la mítica “Tierra de Canaan” y a quien termina acompañando. Su decisión de ir con ella les llevará en un viaje que cambiará el destino de ambos mundos para siempre.
